Während des Alpha-Kurses wird eine Einführung in die Sakramente der Taufe und des Heiligen Abendmahls / Heilige Kommunion gegeben (s. Kap. 14 "Welchen Stellenwert hat die Kirche?" in "Fragen an das Leben"). Die Vermittlung des Heiligen Abendmahls / Heilige Kommunion erfolgt im Rahmen eines informellen Gottesdienstes, der am Sonntag morgen des Alpha Wochenendes stattfindet (deshalb ist dieser Teil auch nicht auf Video aufgenommen).
Alpha wird nun weltweit und auch in Deutschland von allen großen Konfessionen und Denominationen durchgeführt und über alle Denominationen hinweg haben sich viele Leiter positiv und unterstützend zu Alpha geäußert. Die Lehre über die Sakramente ist bei Alpha insofern begrenzt, als hier lediglich die Sakramente behandelt werden, die allen großen Konfessionen und Denominationen gemeinsam sind. Beispielsweise lehren wir über den grundlegenden Sinn der Taufe, aber wir betreten nicht das kontrovers diskutierte Terrain "Kinds- oder Erwachsenentaufe".
Wir ermutigen all diejenigen, die noch nicht getauft worden sind, sich am Ende bzw. nach dem Kurs taufen zu lassen. In der anglikanischen Kirche, aus welcher der Alpha-Kurs ja entsprungen ist, wir die Kindtaufe üblicherweise praktiziert, weil die Anglikaner daran glauben, dass dies so biblisch sei. Hier werden, wie in vielen anderen Denominationen auch, Gläubige, die bereits als Kind getauft worden sind, nicht ein zweites Mal getauft. Aber von anderen Denomination, insbesondere Baptisten, Pfingstlern oder Gemeinden mit neo-pfingstlerischem Hintergrund wird diese biblische Auffassung nicht akzeptiert. Also sehen wir davon ab, diese spezifischen Glaubensauffassungen zu den Sakramenten im Alpha-Kurs detailliert darzulegen und bitten auch die anderen Denominationen, ihre Lehre gleichermaßen "einzuschränken". Das ermöglicht uns (über alle Konfessionen, Denominationen und Traditionen hinweg), den Menschen, die sich auf dem Weg zum christlichen Glauben befinden, die gleichen Inhalte zu vermitteln. So können Menschen ihre Familie und Freunde zu einem Alpha-Kurs in anderen Teilen des Landes oder sogar der Welt einladen, ohne vorher die theologischen Positionen der durchführenden Gemeinde überprüfen zu müssen und ohne sich rückversichern zu müssen, dass diese Positionen mit ihren eigenen Glaubenshaltungen übereinstimmen.
Um es noch einmal zu betonen: Im Falle des heiligen Abendmahls/ der heiligen Kommunion versuchen wir nur die Lehre zu vermitteln, der alle großen Denominationen und Traditionen zustimmen können. Es ist uns bewusst, dass einige Denominationen und Traditionen gerne noch mehr hinzufügen würden. Aber wir bitten nochmals darum, dies nicht während des Alpha-Kurses zu tun. Sie sind natürlich frei darin, dies im Anschluss an den Kurs in einem eigenen denominationsspezifischen Kurs nachzuholen. So werden z.B. die eigenen Sichtweisen der anglikanischen Kirche (also offensichtlich die, von denen sie glaubt, es sei die biblische Sichtweise) in Holy Trinity Brompton im Konfirmationskurs gelehrt. Andere Denominationen, z.B. Katholiken oder Baptisten, werden in solchen Kursen sicherlich andere Schwerpunkte und andere Meinungen basierend auf ihrem Bibelverständnis lehren.
Obwohl also während des Alpha-Kurses nur eingeschränkt über die Sakramente gelehrt wird, bilden dennoch sowohl die Lehre über als auch die praktische Seite der Tauf- und Abendmahls- / Kommunionssakramente einen wichtigen Teil des Kurses.